便秘可以通过观察便秘频率以及大便干湿状态初步诊断，但是便秘也可由肛周疾病如痔、瘘、结肠癌、直疝等引起。因此需要进一步的诊断检查，方法如下：
1.直肠指检
    患者一般取左侧卧位、仰卧位或者肘膝位，医生戴手套并涂以石蜡油等润滑剂，轻轻按摩肛门周围后，手指缓缓插入肛门和直肠进行触摸检查。直肠指检有助于了解患者有无直肠肿瘤、炎症、脱垂、狭窄、粪块、痔疮、肛裂、肛门括约肌痉挛或松弛，判断有无出口梗阻性便秘。直肠指检是便秘初步筛选的重要检查之一。
2.结肠镜检查
    结肠镜检查时需要将一根数米长、手指粗的镜子从肛门一直插入到盲肠附近，这样医生就可以很直接地观察患者肠道里面的情况，如黏膜有没有充血水肿，肠腔内有没有肿块堵塞，肠道内有没有溃疡或息肉等。便秘的患者出现腹痛、大便带血、大便形状变细或者同时出现消瘦等情况时，就很有必要做这个检查了。但怀疑有肠道穿孔，肠道急性大出血期间或者炎症很重，此时肠道极易被结肠镜损伤，不适宜进行结肠镜检查：此外，老年患者、有冠心病和高血压的患者、肺功能差的患者、有过中风病史的患者等做这个检查时一定要慎重。这项检查较大的优点是可以做病理活检以及一些基本的治疗(取息肉)。
3.X线检查
    钡餐检查这是通过消化道充气后，吞入X线下可以显影的钡剂后摄影，仔细观察消化道病变的一种方法。钡餐检查一方面可以发现患者有无器质性病变，同时还可用于了解钡剂通过胃肠道的时间、小肠与结肠的功能状态。正常状态下，钡剂在12～18小时内可到达结肠脾曲，24～72小时内应全部排出结肠，便秘时往往排空延迟。肠易激综合征者常表现为结肠袋形加深、结肠痉挛，有时出现线样征象。对于完全性肠梗阻的病人来说，钡餐检查应属禁忌。为了明确结肠器质性病变的性质、部位与范围，宜采用钡剂灌肠。高质量的气钡双重对比造影检查甚至可以检查到直径0.5厘米的微小癌灶。但不能取组织做病理检查是这种检查的缺点。