解剖缺陷肛门外括约肌浅部在肛门后部形成肛尾韧带，该韧带较坚硬，伸缩性差，承受粪便压力较大，且肛管后正中线部位血供不足,均是容易发生肛裂的因素。
    在直肠与肛管的交界处形成一条不整齐的线,叫齿状线。发生在齿状线以下，深及肛管皮肤全层的裂开,形成感染性梭形溃疡的病变,称为肛裂。肛裂大多发生在肛管后壁正中部，少数在前壁正中部。各年龄段均可发病,多见于30~40岁中年人。
    病菌感染急性和慢性肛窦炎、肛乳头炎、内痔和息肉等是引起感染的主要原因。致病菌侵入肛腺，引发感染，在肛管皮下组织内生成脓肿,破溃后形成溃疡。小型浅部血栓因感染发生血栓性静脉炎，导致肛裂。
    撕裂损伤干硬粪团通过肛管时，易引起肛管撕裂，尤其是肛门先天性发育不良者，更易受到损伤。肛裂的发生是多种致病因素相互作用的结果，肛裂病人的典型临床表现是疼痛、便秘和便血。