肛瘘主要表现为从肛门周围皮肤上的疮口不断地向外流脓和脓血。肛瘘患者都有自己切身的体会与痛苦。一旦肛瘘形成，自愈的机会极少，瘘管复杂化后，带来许多麻烦与一定的危害性。肛瘘的危害有：
    剧烈活动后可促使脓汁外溢， 脓水污染内裤。局部经常受到安慰，皮肤磨擦、瘙痒，非常痛苦，影响工作和学习，久而久之可使身体虚弱消瘦，精神不振，抗病能力下降，出现贫血，发作亦越加频繁，形成互为因果。
    由于多次反反复作，脓液可穿破管壁顺括约肌间隙蔓延而形成多发性、复杂性肛瘘，不但给治疗带来了困难，而且也影响到肛门的正常生理功能。
    肛瘘需要长期的治疗，因为肛瘘是多发性的，可形成直肠阴道瘘、直肠尿道瘘和直肠膀肤瘘，危及周围脏器。并且肛瘘有恶变倾向。
    所以肛瘘患者要及时的正确的治疗肛瘘，不可等到瘘管复杂化以后才采取措施进行治疗，不仅会给身体造成很大的危害，也会增加治疗肛瘘的费用。