肛瘘多为一般化脓性感染所致，直肠肛管外伤继发感染也可形成肛瘘，直肠肛管恶性恶变也可溃破成瘘管，古人根据肛瘘的症状，将其形象的比喻为就像破房子经常漏水一样，因为肛瘘主要表现为从肛门周围皮肤上的疮口不断地向外流脓和脓血。肛瘘患者都有自己切身的体会与痛苦。一旦肛瘘形成，自愈的机会极少，瘘管复杂化后，带来许多麻烦与一定的危害性。

    首先是脓水污染内裤，剧烈活动后可促使脓汁外溢，局部经常受到刺激，皮肤磨擦、瘙痒，非常痛苦，影响工作和学习，久而久之可使身体虚弱消瘦，精神不振，抗病能力下降，出现贫血，发作亦越加频繁，形成互为因果。

    由于多次反反复作，脓液可穿破管壁顺括约肌间隙蔓延而形成多发性、复杂性肛瘘，不但给治疗带来了困难，而且也影响到肛门的正常生理功能。

    肛瘘需要长期的治疗，因为肛瘘是多发性的，可形成直肠阴道瘘、直肠尿道瘘和直肠膀肤瘘，危及周围脏器。并且肛瘘有恶变倾向。