1.冷冻治疗
    用冷冻的方法可使尖锐湿疣内结冰，形成组织局部的高度水肿，从而破坏疣体。冷冻治疗的较大好处是局部 迹，好了率约70％左右。治疗过程中除局部红肿，疼痛及水疱反应外，一般无明显后遗症。可用喷雾法或直接接触法，适用于平坦较小的疣体。冷冻治法无毒性，不需要进行麻醉，若应用得当，不致引起疤痕形成。　
2.激光治疗
    激光治疗是目前治疗肛门疣病较为理想的一种治法。具有时间短，出血很少，不产生瘢痕， 了局部器官组织的正常生理功能及反复率低的优点。适用于处理广泛性疣，特别是对冷冻治法无效者。
3、小创伤治疗
    小创伤治疗是进入90年代后兴起的治疗方法。它的原理是利用微波的高频震动，使疣体内部水分蒸发，坏死脱落。微波治疗的特点是，疣体破坏有效，不易反复，但创面恢复较慢，容易继发感染。所以微波治疗特别适用于治疗疣体较大的，孤立、散在的，同时要远离包皮系带的尖锐湿疣，以防损伤包皮系带，影响男性的性功能。
4.药物治疗
    适用于处理各种类型的泌尿生殖器疣，特别是冷冻治疗、激光治疗及手术治疗后反复者。