苏州东吴中西医结合医院中医医生认为肛乳头瘤是中医“脱肛”的一种，也是由于多由中气不足、病后及妇女生育过多，体质虚弱，或因便秘努责所致。 临床上虽有虚实之分，但以虚者为多，实证较少。其病位在大肠，与肺、脾、胃、肾等脏腑有关。中医治疗以益气固脱为法，可予补中益气药物内服，以提升阳气。其类型有：
1.湿热型——肛门灼热疼痛或痛痒相兼，肛窦焮红，乳湿头水肿。伴心烦口苦，小便黄赤，大便干燥。舌红，苔黄腻，脉弦数。宜清热利湿，方用龙胆泻肝汤。
2.热毒型——烦热口渴，大便秘结，小便黄赤，肛内灼痛，肛窦红肿，乳头肥红，溢出血水或流脓水，舌红，苔黄，脉弦数。宜清热解毒，方用内疏黄连汤加减。
3.湿浊型——肛窦及肛乳头水肿，皮肤糜烂，肛门湿痒。可伴腹胀纳呆，身重困倦等。舌淡红，苔白腻，脉滑。宜利湿化浊，方用萆薢渗湿汤加减。
4.虚火型——肛门微痛、下坠，肛窦或肛乳头暗红，伴大便干涩，口渴。舌红少津，脉弦细数。宜养阴清热润肠通便，方取增液汤加减．
苏州东吴中西医结合医院中医的外治法包括四种：熏洗法，涂药法，塞药法，灌肠法。